die datensicherung könntest du mit nem live-system versuchen. das linux sollte sich gegen den virus durchaus zur wehr setzen können und damit hättest du auch keine neuinfektion.
welches windows benutzt du eigentlich?
bei "nur" reparatur bin ich mir nicht sicher, ob er die systemordner komplett neu anlegt oder einfach nur die daten überschreibt.
außerdem würde ich als virus programmierer sicherstellen, dass es sich nicht in solchen ordnern versteckt

demnach kommst du wahrscheinlich um ne neuinstallation nicht herum, wenn du für immer ruhe haben willst.